地魔在食死徒盧修斯·馬爾福的家中召開會議。作為背叛者身份的西弗勒斯·斯內普也來到了這里。大家紛紛向伏地魔匯報哈利·波特轉移地方的時間。霍格沃茨的上任校長阿不思·鄧布利多曾經給哈利的姨父姨母家施了個魔法，在他十七歲成年（魔法世界的成年歲）那天，魔法將會失效，伏地魔就能找到他。斯內普向他的主人說了哈利真正轉移的時間，于是，他們確定了一個計劃。

在離這兒很遠的地方，鳳凰社成員來到了他的家中，將他的姨父一家人帶到了安全的地方，他也將轉移。哈利·波特看著這生活了將近十七年的地方，有種特別的、說不出的感覺涌上。然而，在轉移的途中，伏地魔與食死徒來追殺他們，卻沒能成功。但是，哈利心愛的貓頭鷹海德薇與最厲害的傲羅穆迪葬身于他們的手下，羅恩（哈利的好朋友）的哥哥喬治，也被咒語擊中，失去了一只耳朵。

魔法部部長來到羅恩的家中，將波特和他的好朋友赫敏·格蘭杰與羅恩·韋斯萊叫了出來，并給了他們鄧布利多的遺囑上寫的東西，一本書、熄燈器和一個金色飛賊（一個小球）。但另外一件東西格蘭芬多的寶劍卻不能給他們。在羅恩的另一個哥哥比爾要與芙蓉結婚那天，一群食死徒沖了進來，他們馬上反應過來，拉著哈利就跑。他們逃到了哈利的教父小天狼星布萊克的家中，那所房子其他人是看不見的。

他們在那里生活了一段時間，并且從小精靈克里切那兒知道了魂器（靈魂碎片，這里指伏地魔的，總共有七片）斯萊特林的掛墜盒的去向，奪了回來。他們跑到了一個森林里。然而，羅恩卻因為嫉妒并憎恨哈利而離他們而去。孤獨的他們為了尋找格蘭芬多的寶劍來到了戈德里克山谷，卻在那兒遭遇了伏地魔與他那條大蛇的襲擊。赫敏拼命將哈利救回，卻在無意中折斷了哈利·波特的魔杖。待哈利醒來之后，覺得一切都沒了，羅恩，他的魔杖……

他們來到了迪安樹林，在那里，他們看到了一個守護神，是一頭美麗的牝鹿。波特獨自一人跟著它來到一個湖旁邊，在湖底，放著格蘭芬多的寶劍。他沒入水中，試圖拿出寶劍，卻被脖子上的掛墜盒勒得喘不過氣來……忽然，一雙手抓住了他，是羅恩，他救了他。他們拿出了寶劍，銷毀了掛墜盒，終于消滅了一個魂器。羅恩向哈利講述了自己的故事：羅恩來到了比爾的新婚小屋中，說了他出走的事。圣誕節的清晨，羅恩的熄燈器指引他方向，最終找到了他們。

赫敏在鄧布利多送給她的書上看到了一個標志，于是，他們來到了同學盧娜的家中請教，卻只看到了她的父親。他們知道了死亡圣器的故事后，遭遇了食死徒，但再一次逃走。后來，他們在森林里被食死徒抓住，帶到了馬爾福莊園。在那里，他們看到了其他的好友，包括盧娜。還看到了背叛哈利父母的人小矮星彼得。然而，彼得因為一絲憐憫而被伏地魔賜給他的銀手活活掐死。這時，哈利的鏡片中閃過一道藍光，那很像鄧布利多的眼睛。可是，他不是已經……這道藍光曾經多次閃過，十分不可思議。在緊急關頭，家養小精靈多比出現并救出了他們，卻犧牲了自己。

他們來到了比爾的貝殼小屋歇息了幾天，就在那段時間中，伏地魔得到了死亡圣器中的老魔杖，是從鄧布利多的墳墓里奪出來的。哈利·波特他們又決定到古靈閣的金庫中尋找魂器——赫奇帕奇金杯。這并沒有成功，反而被妖精拉環奪走了寶劍。他們坐著一只火龍離開了。

哈利他們決定到霍格沃茨學校去，卻碰到食死徒。在危急時刻，一個人讓他們藏在了豬頭酒吧里，掩護了他們。哈里看到了那個人的眼睛，是藍色的，在他在鏡子里看到的藍光一模一樣……原來，他是鄧布利多的弟弟——阿不福思·鄧布利多。哈利在那里見到了他的許多好朋友，并潛入了學校，碰到了格蘭芬多學院的院長，麥格教授，向她說明了情況。

麥格教授組織了全校老師與部分學生來抵抗伏地魔與他的追隨者，提供哈利所需要的時間。他知道了拉文克勞的冠冕在哪，并找到銷毀。之后，哈利親眼目睹了背叛者斯內普的死。他是被伏地魔的大蛇咬死的。斯內普看到哈利后，用一個瓶子裝了一種銀色的東西，哈里知道那是什么——是記憶。哈利看到了他眼中的某種東西正在消逝。哈利將記憶放入了冥想盆里……真相大白了。斯內普是個好人，他一直在做間諜，為鄧布利多提供情報，并且從孩提時代就愛上了哈利的母親，莉莉·伊萬斯。原來，他自己也是伏地魔的一個魂器，只有他死，伏地魔才有可能倒下......一切都結束了，只剩下一件事：死。但哈利并沒不畏懼。他面對強大的伏地魔，沒有絲毫反抗。他倒地后，來到了一個夢境。在那里，他見到了鄧布利多，與他交談，安慰他。隨后，他又醒來，與伏地魔展開戰斗。他向著天空喊出他最熱切的希望：除你武器。這是一個人人都會的魔咒。而伏地魔出的魔咒：阿瓦達索命，則是無人能抵擋的殺戮咒。但是，伏地魔倒下了，像個凡人一樣死去……

死亡圣器怎么能戰勝純正的靈魂呢？

九年過去了，傷疤從來都沒再疼過。一切太平。